体外转录试剂盒 K481/491/501

RNA Transcription Kit

 CAT#

SIZE

PRICE(¥)

K481-T3

10 rexs

600

K491-T7

10 rexs

600

K501-SP6

10 rexs

600

注意: 该试剂盒不适宜用于RNA探针的制备
K481        10 reactions w /T3 RNA polymerase
K491        10 reactions w/ T7 RNA polymerase
K501         10 reactions w/ SP6 RNA polymerase
剂盒组成:

Components for 10 reactions

Quality

SK481

SK491

SK501

T3 RNA Polymersae
T7 RNA Polymerase
SP6 RNA Polymerase
5´ Transcription Buffer
10 mM rNTPmix
100 mM DTT
DEPC-H2O
Ribonuclease Inhibitor
DNase I ( RNase free)
Proteinase K
Digestion Buffer
Protocol

100 U

 

0.2ml
20ml
30ml
1 ml
400 U
110U
1 mg
2 ml
1份

 

100 U

0.2 ml
20ml
30ml
1 ml
400 U
110 U
1 mg
2 ml
1份

 

100U
0.2 ml
20ml
30ml
1 ml
400 U
110 U
1 mg
2 ml
1份

简介:该试剂盒主要用于体外转录合成RNA, 用于小量RNA的制备。转录的模板必须克隆在T7, T3或SP6 promoter之后。
注意事项:
1)整个实验必须戴手套操作,防止RNase的污染。
2)除Tris缓冲外,所有缓冲必须用DEPC处理。所有的管子,枪头必须高温灭菌。Tris缓冲液用DEPC-H2O配置,高温蒸气灭菌。DEPC-H2O的制备:高纯度的水中加入DEPC,终浓度为0.1%,37ºC保温8小时,然后高温蒸气灭菌,如仍有DEPC气味,将溶液置于90ºC水浴保温1小时。
3)用于转录的质粒模板必须是无RNase污染。
模板的制备:
1)用合适的试剂盒制备模板质粒。
2)模板的线性化。用合适的限制性内切酶在Promoter和插入片段的下游将质粒切开。
3)Proteinase K用100ml水解。在酶切反应体系中加入Proteinase K和2倍体积的Digestion Buffer, 使Proteinase K的终浓度为50mg/ml, 37ºC保温30分钟。

4)用等体积的苯酚-氯仿(1:1, v/v)抽提两次,每次吸取上层水溶液。
5)加入0.1倍总体积的用2.5倍体积的无水乙醇,-20C放置20分钟或更长的时间,离心收集DNA, 沉淀用70%乙醇(用DEPC-H2O配置)洗一次。
6)DNA用10 mMTris-HCl (pH7.4)/0.1 mM EDTA (该TE用用DEPC-H2O配置) 溶解,浓度为1mg/ml左右。DNA的定量:用合适的Agarose电泳,与DNA标准比较估计出DNA的浓度。
转录反应:
1) 按以下次序在冰上加入各试剂:
4 ml  5´ Transcription Buffer
2 mg  限制性内切酶和Proteinase K处理过的 DNA 模板
2 ml  10 mM rNTPmix
2 ml  100 mM DTT
40U  Ribonuclease Inhibitor
5-10 ml  400-800Ci/mmol 10mCi/ml [a-32P] rUTP
(注意:如仅仅用于合成RNA, 无须加入同位素)
0.8 ml T3(K481)或 SP6 (K501)或T7 RNA Polymerase (K491)
x ml  DEPC-H2O (使反应总体积为40ml )
2) 混匀,37ºC保温60分钟。
3) 加入2ml DNase I (RNase free)(10 U), 37ºC保温10分钟。
4) 产物可以不经过分离立即使用,或-70ºC保存备用。如要除去反应体系中的rNTP和其它蛋白质,可以用BBST K581 RNA Clean-up Kit 纯化,也可以1-ml Sephadex G-50柱纯化,但要求柱子无RNase污染。
注意:
1)不建议该试剂盒制备的RNA的探针。如果需要制备RNA探针,请和BBST联系。

2)T3和T7 RNA聚合酶通常作用于各自的Promoter,但是如果DNA的3’-末端突出,RNA聚合酶有可能进行非特异性转录。所以酶切质粒产生的转录模板最好是平断或者5’-末端突出。如果T7 RNA聚合酶的用量过大,模板中仅有T3 Promoter, T7 RNA聚合酶有可能从T3 Promoter启动转录,尽管转录的效率不高。反之亦然,T3 RNA聚合酶也可能从模板中唯一的T7 Promoter转录。如果模板中含有T3和T7两个promoter, 转录将是Promoter专一的。SP6 Promoter的专一性比较好,但转录能力稍差。
3)非同位素转录。在我们提供的方法中加入了同位素,能制备出特异的同位素RNA探针。如果转录的目的是为了制备用于体外翻译,细胞微注射,可以用1 µl 10 mM rUTP代替[a-32P]rUTP。
4) 如果转录DNA模板对下游实验有影响的话,可以反应后加入RNase-free的DNase,除去DNA。处理方法:每µg DNA加入10U DNase(RNase-free),37℃保温15分钟,用Phenol-Chloroform抽提一次,在上清中加入0.1倍体积的3M Sodium Acetate (pH5.2)和2.5倍体积的无水乙醇沉淀RNA。
5)Promoter的选择:制备的探针用于S1核酸酶分析和Northern Blot时,所选用的RNA聚合酶转录出的产物必须和目标RNA互补。 6)转录产物低的原因:DNA纯度不够;DNA污染RNase; DNA中的过量的NaCl抑制RNA Polymerase的活性等。