3S柱离心式细菌总RNA抽提试剂盒 K3630/3640

3S Spin Bacterial Total RNA Miniprep Super Kit

CAT#

SIZE

PRICE(¥)

K3630

20次

450

K3640

100次

1350

注意事项:
(a)RNase酶非常稳定,是导致RNA降解最主要的物质。它在一些极端的条件可以暂时失活,但限制因素去除后又迅速复性。用常规的高温高压蒸气灭菌方法和蛋白抑制剂不能使所有的RNase完全失活。RNase广泛存在于人的皮肤上,因此,制备RNA时必须戴手套。
(b)RNase的又一污染源是取液器。根据取液器制造商的要求对取液器进行处理。一般情况下采用用DEPC配制的70%乙醇擦洗取液器的内部和外部,基本达到要求。

1.塑料制品、玻璃和金属物品的处理
(a)塑料制品:尽可能使用一次性无菌塑料制品。已标明RNase-free 的塑料制品,如没有开封使用过,通常没有必要再次处理。对于国产塑料制品,原则上处理后方可使用。处理方法如下:
(1)在玻璃烧杯中注入去离子水,加入DEPC使DEPC的终浓度为0.1%。注意:DEPC为剧毒物,活性很强,在通风柜中小心使用。
(2)将待处理的塑料制品放入一个可以高温灭菌的容器中,注入DEPC水溶液,使塑料制品的所有部分都浸泡到溶液中。
(3)37℃下处理过夜。
(4)将DEPC水溶液小心倒到废液瓶中,用铝箔封住含用DEPC水处理过的塑料制品的烧杯,高温高压蒸气灭菌至少30分钟。
(5)用合适的温度(80-90℃)烘拷至干燥。置于干净处备用。

(b)玻璃和金属物品250°C烘烤3小时以上。

表1.试剂盒组成:


Components and Size

K3630 (20 Extractions)

K3640(100 Extractions)

3S Column
1.5 ml Collection tube
2.0 ml Collection tube
RLT Solution(a)
RW Solution
RPE Solution(b)
DEPC –H2O
Lysozyme(c)
Lysozyme Dilution A(c)
Lysozyme Stablizer(c)
Protocol

20根
20只
20只
8 ml
10 ml
10 ml
1 ml
20mg
1.5 ml
1.5 ml
1份

100根
100只
100只
40 ml
50 ml
50 ml
5 ml
100mg
7.5 ml
7.5ml
1份

注意事项
a. 在收到试剂盒后,应将RLT Solution取出存放于4ºC下。
b. RPE Solution 在首次使用前,必须加入等体积的无水乙醇,无水乙醇必须是新开封的, 保证无RNase污染。
c. 融菌酶使用前按下列要求处理: K3630: Lysozyme 用1.5 ml Lysozyme Dilution A溶解后, 再加入1.5ml Lysozyme Stablizer,混匀后-20度保存.  K3640: Lysozyme 用7.5 ml Lysozyme Dilution A溶解后, 再加入7.5ml Lysozyme Stablizer,混匀后-20度保存.
表2.3S柱的特性:


最大结合力

50 mg

最大上样体积

700 ml

最小洗脱体积

30 ml

样品的最大使用量

动物细胞

1´107

动物组织

30 mg

细菌

1´109

酵母

1´107

植物组织

100 mg

丝状真菌

100 mg

用户需自备的试剂和材料:
无水乙醇,70%乙醇(DEPC-H2O配制),RNase-free的Eppendorf管和Tips, 离心机等。

细菌总RNA的抽提

1.将适量的指数生长期细菌(最多可达1×109)4℃下5,000´g离心3-5分钟,彻底弃上清培养基。
2.按要求准备Lyzosome.。
3.细菌菌体用配制好的100μl溶菌酶悬浮,用振荡器混匀,室温放置5-10分钟。
4.加350ml RLT Solution,剧烈振荡,以保证细菌的充分裂解。
5.高速离心两分钟,将上清转移到无菌RNase free的1.5ml离心管中。
6.加250ml无水乙醇到裂解液中,用枪头混匀,注意即使出现沉淀也不要离心。
7.将3S柱放到一个2ml 的收集管中,将700ml 样品(样品中如果有沉淀,应将沉淀一起加到3S柱中)加到3S柱中,室温10000´g高速离心1分钟,倒去收集管中的废液,将3S柱放到同一收集管中。
8.加200ml RW Solution加到柱子中,42℃水浴保温2分钟,室温下高速离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将柱子放入同一个收集管。
9.加300ml RW Solution加到柱子中,42℃水浴保温2分钟,室温下高速离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将柱子放入同一个收集管。
10.加500ml RPE Solution加到柱子中,高速离心1分钟。
11.倒掉收集管中的废液,将柱子放入同一个收集管, 室温高速离心2分钟以除去残留的RPE Solution。
12.洗脱得到的RNA可立即使用,也可存放在-20℃或-70℃备用。

RNA样品的储存,定量和纯度的确定:
储存:洗脱得到的RNA可立即使用,也可存放在-20℃或-70℃一年以上。不得反复冻融。
定量:样品用RNase-free水稀释,测定A260,按1 A260 = 40 mg/ml计算产率。注意稀释后样品的吸收值必须大于0.15,否则不准确。
纯度:测定A260/280. 该比值受稀释样品用溶液的pH影响。如需要准确的比值,用10 mM Tris-HCl pH7.5 稀释样品。

纯化过程中可能出现的问题及解决方法:


现象

原因

解决方法

加入裂解液后非常粘稠,样品转移比较困难

首次离心柱子堵塞

 

RNA的产率很低

 

 

RNA发生降解

 

微量DNA污染

 

 

A260/A280过低

样品用量太多

 

样品太多, 或裂解不完全。

起始样品太多,或裂解不完全
RNA仍在柱子上

样品存放时间太长
裂解或匀浆不完全
操作不规范
裂解液中没有加入b-ME

提高RLT的用量,用多根3S柱纯化同一个样品

 

提高离心力,或降低样品用量或提高提高RLT的用量

 

降低样品用量或提高提高RLT的用量

将DEPC-H2O预热到50°C,再在50°下保温2分钟

用新样品
变匀浆方式,降低样品用量
严格按照要求执行
如不肯定,请再加入b-ME,稍过量的b-ME不会影响RNA的纯化

用DNase I(RNase-free)处理

测定时用10 mM Tris-HCl pH7.5 稀释样品,比色杯用0.1M NaOH, 1 mM EDTA洗,再用RNase-free水处理