
Go3S柱离心式基因组DNA小量抽提试剂盒 K201/202/203
3S Spin Genomic DNA Miniprep Kit V3.0
CAT# |
SIZE |
PRICE(¥) |
K201 |
50 |
370 |
K202 |
100 |
700 |
K203 |
250 |
1500 |
试剂盒组成:
Components and Size |
K201 |
K202 |
K203 |
3S Column |
50根 |
100根 |
250根 |
注:
(a) 首次使用前,必须在Wash Solution瓶中加入50ml无水乙醇,充分混匀后使用。每次使用后将瓶盖盖紧,以保持Wash Solution中的乙醇含量
(b) Proteinase K使用前每6mg加入150µl H2O,短时间4℃保存,长时间-20度保存备用。不得Proteinase K直接加入到Digestion Buffer中,以免酶失活。
基本原理:
该试剂盒的核心是能特异吸附DNA的3S柱。3S柱是一种能放入普通1.5ml和2.0ml eppendorf管中的离心式小柱,柱子的底部有惰性大分子材料,它能由选择性吸附核酸物质,但不吸附蛋白质、多糖和其它非核酸类物质。制备基因组DNA时,首先根据要求准备样品,后用Proteinase K和去污剂裂解组织和细胞,释放出基因组DNA。3S用于吸附基因组DNA, 经简单的洗涤步骤除去非特异性结合的杂质, 然后用Elution Buffer, TE 或者水洗脱。
质量控制:
基因组DNA抽提效果由从大肠杆菌细胞中制备细菌基因组DNA和从人血液中抽提人基因组DNA,判定,抽提的DNA用0.7%Agarose电泳和UV分光光度计检查抽提的基因组DNA的质量。
主要用途:
从多种组织和细胞中小规模快速抽提基因组DNA。
主要特点:
1. 适用范围广,适用于大多数组织和细胞基因组DNA的抽提。
2. 无需酚和氯仿抽提,无需乙醇沉淀,安全。
3. DNA纯度高,得率高,无蛋白质污染,制备的DNA适用于常规分子生物学实验。。
基因组DNA抽提方法
1.样品准备:
1) 血液:
(1) 血液收集:血液必须用ACD抗凝(ACD: 0.48% Citric Acid, 1.32% Sodium Citrate, 1.47% Glucose)。 6 ml 血液用1 ml ACD抗凝。因为从用肝素抗凝的血液抽提的DNA常有PCR抑制剂存在,不能用于PCR反应。
(2) 由于红细胞和血小板不含细胞核,血液中的基因组DNA主要来自于白细胞和血液中的病毒等。通常从200µl血液可获约2-10µg DNA。如果需要较大量的DNA,可以用1000µl以上的血液,处理方法如下:每1000µl血液中加入2ml无菌水,5000×g,离心2分钟。沉淀用400µl Digestion Buffer将白细胞悬浮起来备用。
新鲜血或血清样品如果体积不超过200ul, 可以直接加入400µl Digestion Buffer¸混匀后使用。
2) 生物组织:
25-100mg组织样品用手术刀切成小块,再用液氮碾碎,或用组织匀浆器匀浆。将粉末收集到1.5ml离心管中,用400µl Digestion Buffer悬浮。
3) 石蜡生物组织:
(1) 将25-100mg石蜡生物组织样品用手术刀切成小块,转入2 ml 离心管(用户自备)中。
(2) 加入1.2 ml 二甲苯溶剂(用户自备)。用振荡器振荡。(目的是除去石蜡)
(3) 用台式高速离心机,室温,12,000转/分,离心5分钟。
(4) 小心移走上清,注意不要移走沉淀物质。
(5) 加入1.2 ml无水乙醇,小心用振荡器振荡,室温放置1分钟。
(6) 室温,12,000转/分,离心5分钟。
(7) 重复步骤5-6一次。(目的是除去残留的二甲苯溶剂)
(8) 打开离心管盖子,37 oC保温10-15分钟。(目的是除去残留的乙醇)
(9) 用400µl Digestion Buffer悬浮, 组织匀浆器匀浆。注意:石蜡切片可以直接使用,无须匀浆。
4)生物体液:
(1) 将体液转移到离心管中,根据体液的性质,确定体液的用量。
(2) 5000×g, 室温离心10分钟。
(3) 小心移走上清,沉淀00µl Digestion Buffer悬浮。如果体液的体积小于200ul, 直接加入Digestion Buffer,是总体积达到400ul,混匀。
5)尿液:
(1) 将尿液转移到离心管中,5000×g, 室温离心10分钟。
(2) 小心移走上清,沉淀用400µl Digestion Buffer悬浮。
6)眼,鼻,喉等拭样(Swabs)
(1) 将拭样(Swabs)转移到离心管中,加入2 ml PBS (或生理盐水,用户自备),室温浸泡2-5小时。
(2) 5000×g, 室温离心10分钟。
(3) 小心移走上清,沉淀用400µl Digestion Buffer悬浮。
7)福尔马林处理的样品:
(1) 将100mg福尔马林处理样品用手术刀切成小块,转入离心管(用户自备)中。
(2) 加入2 ml PBS (或生理盐水,用户自备),室温浸泡30分钟。
(3) 12000专/分钟, 室温离心2分钟。
(4) 小心移走上清,加入2 ml PBS (或生理盐水,用户自备),室温浸泡30分钟。
(5) 12000专/分钟, 室温离心2分钟。
(6) 小心移走上清,沉淀用500µl Digestion Buffer悬浮, 组织匀浆器彻底匀浆。匀浆效果的好坏直接影响Proteinase K的降解效果。
(7) 取500ul匀浆(包括可能的组织块)全部转移到1.5 ml离心官中。
8) 培养细胞样品的处理:
(1) 收集细胞
a. 悬浮培养细胞
1000´g室温离心5分钟,彻底去上清,进行步骤2。
b. 单层培养细胞
蛋白酶消化细胞:倒掉培养基,用PBS洗涤细胞,然后用胰蛋白酶消化细胞。当细胞从培养瓶表面脱落以后,将细胞转移到离心管中,1000´g离心5分钟,彻底去上清,进行步骤2。
(2) 用400µl Digestion Buffer悬浮
9) 培养细菌细胞的处理
(1) 准备200µl 过夜培养细胞
(2) 12000转/分钟, 离心2分钟。彻底移走上清液,细胞用150µl TE悬浮起来。
(3) 溶菌酶处理。对于格兰氏阳性和格兰氏阴性菌酶解时间的要求是不一样的,详见下表。根据下表取适量的溶菌酶,用50µl TE溶解后全部加入到细菌样品中。格兰氏阴性菌也可以不要用溶菌处理。
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TE中溶菌酶浓度 |
室温下酶解时间 |
格兰氏阴性菌 |
400mg/ml |
5-10分钟 |
格兰氏阳性菌 |
3 mg/ml |
15-30分钟 |
注意:
1. 如果样品不能马上用于抽提基因组DNA, 可以-20 oC保存备用。
2. 样品不能反复冻融,否则基因组DNA的完整性(长度)和产率都会受到影响。
3. 样品不要太多,否则基因组DNA的纯度和产率反而下降。
2. 在按要求处理的样品中加入3ul Proteinase K,混匀,55°C保温10-60分钟。
注意:
1) 不得将Proteinase K先加入到Digestion Solution,再加到样品中。
2) 保温时间取决于样品的类型。 对于细胞样品,55°C保温5分钟足以使细胞裂解,释放出基因组DNA。而对于组织类样品,55°C保温则视降解效果而定。降解完全的样品应是透明粘稠液体。组织类样品一般在1-3小时内作用完全。过夜处理通常不影响产率。
3. 高速室温12000转/分离心5分钟,将上清转移到1.5ml无菌离心管中,加入300ul Solution B, 混匀。
子也可以不盖,但是如果您同时有很多样品,担心混淆或弄翻溶液,建议您盖上盖子)。转移时用1ml Tip头取样品。
5. 用台式离心机,12,000转/分,室温离心1分钟。
6. 取下3S柱,弃去离心管中的废液。将柱子放回同一根离心管中,加入500µl Wash Solution, 12,000转/分,室温离心1分钟。
7. 重复步骤6一次。
8. 取下3S柱,弃去离心管中的全部废液。将柱子放回同一根离心管中,10,000转/分,室温离心2分钟,以除去残留的Wash Solution。
9. 在柱子中央加入100µl TE, 将柱子放入新的干净1.5 ml或2.0ml离心管中,室温或37-55°C放置2分钟。12,000转/分,室温离心1分钟。收集管中的液体即为基因组DNA。根据用途,样品可以4°C或-20°C保存。
注意:
1)为提高洗脱效率,可以将TE预热到37-55°C。
2)如果样品中基因组DNA含量很低,用30µl TE洗脱可以提高洗脱液的样品浓度,但产率有所下降。重复步骤8-9,可以提高产率20%。
10. 用分光光度计测量DNA含量按1OD260=50µg基因组DNA,或者走0.7% Agarose 胶判定DNA的完整性,也可以判定样品中是否有RNA。
注意:
1)血液样品中的DNA产量取决于血细胞的数量。
2)从Agarose Gel仅能观察到白细胞基因组DNA, 血清中病毒DNA因含量太少,不能用Agarose Gel直接观察。
3) 通常50µl PCR反应中用2-5µl DNA。



